芹菜根瘤病或根结线虫要在定植以前预防，使用阿维菌素或者噻唑膦颗粒剂沟施或者穴施，瓜类叶菜类注意噻唑膦不能直接接触根系。威百亩熏蒸效果也不错，同时防治土传病害和根结线虫。最好的防治方法还是增强蔬菜长势和抗病能力。建议多次冲施碧卡菌肥加根聪聪。

芹菜长根瘤是根结线虫引起的，虽然药剂防治有一定的效果但污染大，防治成本高。有条件的话建议使用水旱轮作防效很好。