主要区别：第一，繁殖习性不同，鲥鱼繁殖在入海口的咸淡水区域，而扁鱼不是第二，珍贵程度不同，鲥鱼是国家一级保护动物，而扁鱼是普通经济鱼类。

鲥鱼为溯河产卵的洄游性鱼类，因每年定时入江而得名。平时生活于海中，每年2月下旬至3月初，生殖群体由海洋溯河作生殖洄游，在5-7月，当水温达28℃左右时，即在江河的支流或湖泊中有洄水缓流、沙质底的江段繁殖。