TBP是一种通用转录因子，而TAFs则具有聚合酶和启动子特异性，起辅助转录激活因子的作用。

在转录起始过程中，前者在种属间高度保守的C端独特结构可直接识别TATA元件，或通过TAFs与DNA结合而后者有的作为TBP结合DNA的媒介，有的作为转录起始复合物组装时其他TAFs与TBP相互作用的桥梁，有的则作为转录激活蛋白与TBP联系的纽带，介导转录激活蛋白对基因转录的激活作用。