农家肥发酵前有臭、腥、酸味，发酵后有微腐类似酒精味。

农家粪肥经过充分高温发酵后几乎没有啥味道，质地松散，是衣家常用的肥料。

家畜等农家肥中含有大肠杆菌、线虫等病菌和害虫，直接使用会导致病虫害的传播，引发作物生病，间接对人体健康产生影响。如未腐熟的鸡粪在土壤中发酵时，容易滋生病菌与虫害的发生。