辞职后把公积金取出来，账户会自动注销掉。

单位终止劳动关系提取住房公积金，职工与单位终止劳动关系，可申请提取本人住房公积金账户本息余额，同时注销该职工的住房公积金账户。办理提取业务前，应由单位经办人到单位公积金缴存网点为其办理账户封存手续。

劳动者离职后，符合提取住房公积金条件，并实际提取住房公积金的，住房公积金管理部门会将其公积金账户注销。