分子是由原子构成，有的分子是单原子分子，如氦气，氖气等惰性气体，原子失去电子或得到电子就成为了离子，离子是带电的，而分子是不带电的。

物质就是由分子构成，比如说O2就是由氧分子构成，而不能说成由氧离子构成，若氧气由氧离子构成，那就带电了还能供人呼吸么所以这也是一点区别。还有就是分子是没有价态的，而离子是有正负价的。