第一是数学科学学院，号称中国第一系，全校所有专业排名第一，也是国内排名第一，世界前二十。

第二是物理学院，中国最早的物理学科专业，国内23位两弹一星科学家有12位在此学习或是工作过，也是世界上公认中国专科排名第一。

第三是化学与分子工程学院，是国内最早成立的化学系，也是国内唯一二级学院确是一级的重点学科，世界排名前十八。