大葱的葱根为弦线状须根，着生于短缩茎的茎节部，随着大葱株龄增加和短缩茎盘增大，新根不断发生，发根能力较强，一株有50～100条根，长30～45厘米，根群主要分布在30厘米以内的表土层。

大葱的根系再生能力较弱，当已发生的根系被切断后，断裂后的根系不能发生侧根，所以大葱经起苗移栽，起苗前已形成的根系就没有多大的利用价值，在成活后葱的生长主要依靠新生的根提供养料和水分。