肺、鳃、皮肤都是两栖动物的呼吸器官。

两栖动物的幼体是用腮呼吸，两栖动物成体用肺和皮肤呼吸，具有一对囊状的肺，结构简单，肺内仅少数褶皱，呼吸面积小。肺缺少毛细血管，皮肤用毛细血管呼吸。无胸廓，采用口咽式呼吸。

两栖动物的生殖和幼体发育必须在水中进行，从而要保护它们生存的水域环境，因此两栖动物还不是真正的陆生脊椎动物。