济南西站主站房为地上3层、地下2层结构。其中，地下第2层为地铁1号线站台地下第1层为换乘空间及设备用房地面第1层为出站厅、售票用房及其他用房地上第2层与站台平齐，主要为进站厅、贵宾室、售票用房及其他用房地上第3层与高架候车室平齐，主要为候车室、附属用房及部分商业用房。站场部分分为4层。其中，地下第2层为地铁1号线地下第1层为地下通廊，由城市通廊、出站通道及出租车道组成地下通廊上部为站台层站场最上部为高架候车室。