有乙方和由乙方负责的区别是：有乙方是指有乙方的存在，但没有明确乙方所要负的具体责任，而由乙方负责则是指有明确的责任是由乙方负责的，比如：某项工程的设计，施工和验收工作由乙方负责。即指明了具体的责任由乙方负责的意思。