三间鱼属于卵生鱼类，繁殖力强，鱼儿的性成熟期在12到18个月，在繁殖期，它们会在浅水区的底部挖洞穴筑巢产卵，不像其它慈鲷鱼品种有明显的护幼行为，容易繁殖，每次可产卵5000到10000粒左右。

温度适宜且储备有足够营养时即产卵，无季节性，为多次产卵类型，产粘性卵于水底硬物上，每次产卵。亲鱼还有护卵行为，受精卵约经48小时孵化，2到3天后仔鱼能自由游动、摄食，开口饲料为枝角类活更小的鱼苗，一旦食物不足即吞食同类。