靖难遗孤真实的结局是被朝廷赦免了，得以回到了故乡生活，这是因为这些靖难遗孤在永乐皇帝朱棣一朝中属于大恶人，很多都被发配到了奴儿干都司为奴为婢，直到朱棣去世，明仁宗朱高炽继位后就选择了赦免了他们的罪行，于是还活着的靖难遗孤才得以重返故里。