同源蛋白：氨基酸序列具有明显的相似性，在不同生物体或同一机体内行使相同或相似功能的蛋白质。

同源蛋白质具有物种差异性和共同的进化起源。研究发现，同源蛋白质越接近，物种的亲缘关系越亲。

蛋白的同源性可以从两方面来说，一个是功能性同源，一个是结构性同源。

对于功能性同源，就是说两种蛋白在不同的生物体呢的功能是相同的，也就是说对与a蛋白在A物种的作用，如果a蛋白缺失，那么在B物种的b蛋白可以代替a蛋白在A物种中发挥作用。

对于结构性同源也就是说，其编码的基因序列相似，其氨基酸序列相似，包括后期的蛋白空间结构，蛋白在细胞中的定位都很相似，这些都是可以通过实验方法得到验证的。