首先是产地不同

鲜百合的主要产地在甘肃兰州的南部山区，那里具有独特的食用百合的生长条件。药百合的主要产区在湖南及江浙一带。

其次外观及内含不同 

鲜百合外表呈白色，如白玉一般，食用时味道是甜的。药百合外表色白中带黄且不具光泽，食用时味道涩而苦。从营养成分上说，药百合含有生物碱和天然多糖以及一些醇类物质，成分含量比较单一而鲜百合不但含有一些天然糖分和多种微量元素，还含有蛋白质和多种维生素，营养成分是比较全面的。

最后，鲜百合可以生食熟食且随时食用，而药百合只能作为药用。