验DNA性别鉴定是最准确的，能达到99.9%。通过外表上的特征来区分公母准确率稍低。具有以下特征。

肉桂小太阳鹦鹉公鸟比母鸟的体型大、头大、喙长。公鸟头部较长而比较扁平，母鸟的头部较小且比较尖。公鸟尾羽尖呈V型，母鸟尾羽尖分叉呈W型。公鸟耻骨间间距小、有兴状突起。 母鸟两耻骨之间间距大，尤其成母鸟能伸进大半个手指， 并且扁平无突起。站姿方面公鸟会昂头挺胸，母鸟将身体尾部靠在栖木上，并且呈现下蹲的姿势。