没太大区别。店章是开店的刻的代表门店的章，有的个体门店刻章并不是公章，公章是在公安部门备案的部门刻的章，一般公章是不能私自刻的，我国的法律规定私刻公章是违法行为。一家公司的公章会用在公司的生产经营活动中，代表公司的经营行为，比如签合同等。