种类不同，基因物质不同，颜色和形状也就不同。

蘑菇子实体有多种颜色的，大多数为灰色，如平菇，灰树花，香菇为棕色，金针菇软化栽培的为白色或者黄色，灵芝红色，海鲜菇白色，双胞蘑菇白色，黑木耳黑色等。

常见颜色的蘑菇大多可以食用，其中灰色的蘑菇有平菇、灰树花，棕色的蘑菇有香菇、茶树菇，白色的蘑菇有金针菇、海鲜菇、杏鲍菇、双孢蘑菇，黄色的蘑菇有榆黄菇，金针菇有的也会呈现黄色。蘑菇做法多样，可以煮制、炒制、烤制等食用。