两者所学的专业不同，研究的方向也不同。生物结构学主要学习和研究生物的组成，包括结构、器官以及构成的系统，最后把研究应用到医学或者仿生学上，生物信息学主要学习和研究的是生物之间的关系，生物内部的信息传递（信号分子）。主要应用于医学。