目前富硒作物主要分类方法有两种，一种将富硒植物分为聚硒植物和非聚硒植物，聚硒植物可作为硒指示植物，如黄芪属植物，本身硒的含量就很高。

大部分农作物不是聚硒植物，我们称之为非聚硒植物，其含硒量都很低另一种将富硒植物分为累积植物(指示植物)、中度含硒植物与低度含硒植物。