锚头蚤可用伊维菌素等药物进行治疗，但是一定要注意用量，如果太多的话，会影响鱼群的健康。而鱼蟹混养池一般使用阿维菌素、伊维菌素等药物全池泼洒来杀灭一些中华蚤、锚头蚤、线虫、蠕虫等鱼体寄生虫。

用生石灰彻底清塘消毒，可杀灭水中的锚头蚤幼虫。鱼种在放养前，用10—30ppm高锰酸钾浸洗15—20分钟。在养殖过程中，若发现鱼体寄生锚头蚤，用90%晶体0.3—0.5ppm全塘泼洒，连续2次可治愈。