1864年6月，随着天京被曾国荃的湘军攻破，太平天国的时代也宣告结束，曾国荃的兄长曾国藩当了两江总督后将“天京”改回1853年（清咸丰三年）3月29日，天王洪秀全和东王杨秀清在文武百官和黎民百姓的跪迎欢呼声中进入金陵城，暂住藩习衙署，不久修缮两江总督衙门，改作天王府，并宣布定都江宁，改名天京，正式建立了与清王朝相对峙的太平天国农民政权。

1864年（清同治三年）曾国荃的湘军攻破天京，轰轰烈烈的太平天国运动宣告结束，两江总督曾国藩将天京改回南京。