工程公司开增值税专票发票，是甲方的要求。甲方只有增值税专用发票，才能抵扣增值税。

工程公司承接建设施工任务，甲方一般都是企业，如房地产开发企业，开发楼盘，他本身不能建造房屋，需要招标工程公司为其建造楼盘，在签订建造合同时，房地产企业会要求工程公司提供9%的增值税专用发票，以便房地产企业在销售房屋时抵扣增值税。所以工程公司要开增值税专用发票。工程公司承建施工业务，除特殊情况外，税率都是9%，开普通发票税率相同。