西昌市新农合住院报销比例如下:1、镇卫生院报销60%，二级医院报销40%，三级医院报销30%，2、手术费1000元内按照国家标准报销，超过1000元按照1000元报销，3、60岁以上老年人住院治疗费及护理费每天可以报销10元，最多报销200元，4、心脑电图、X光透视、拍片、化验、理疗、针灸、CT、核磁共振等辅助检查项目最多报销200元。