1、发酵温度：根据菌类生长的条件严格控制罐内温度，通过温度计进行检测，并以间接方式进行升温或降温控制与调节。先进的设备均可实现温度的自动化测试、记录和控制。

2、发酵罐内的压力：罐内保持一定的压力可有效地防止杂菌的侵入。一般种子罐压力为4.9MPa，发酵罐压力为2.9～4.9MPa。

3、通气与搅拌：好氧菌需要有足够的氧气才能快速繁殖与生长，为此必须通入无菌的空气。由于不同菌种以及同一菌种在不同的发酵阶段对氧的需求量各不相同，因此必须根据实际情况确定通气量和搅拌速度。发酵液中的溶解氧可经自动测试仪测定，也可以亚硫酸钠滴定。

4、pH值：发酵液的酸碱度对发酵影响很大，必须通过反复精确实验，方可确定某微生物生长和繁殖的最适pH值，并应在发酵过程中自动控制与严格地调节。