这两个单位有本质的区别。代建单位是业主方的代表，是业主方请来代为进行整个工程建设全过程管理的单位，是施工项目招投标、工程建设的组织和管理单位，而施工单位是指具体的工程项目施工单位，他需要接受和服从代建单位的管理。