育种中的制种一般是指制杂交种，如制杂交水稻种子。人们通常把常规种子繁殖叫繁育种子，因它只是一个繁殖过程。而杂交水稻种子需要不育系（母本）和恢复系（父本）进行杂交，得到的在不育系上结实作为种子，这种种子父亲和母亲来自不同两个植株，过程比较复杂，人们就称为制种。