深圳湾水系位于深圳市的中南部，主要包括特区境内的南山区、福田区，控制面积174.62km2。该分区内共有大小河流26条，独立河流5条，一级支流13条，二、三级支流8条。流域面积大于50km2的河流仅1条（大沙河），流域面积大于10km2的河流4条，流域面积大于5km2的河流6条。