1、品种区别。海蛎子一般是指褶牡蛎，属于瓣鳃纲牡蛎属软体动物，而生蚝一般是指牡蛎，属于双壳纲牡蛎属软体动物，二者品种不同

2、生长环境区别。海蛎子一般生长在海边的礁石上，而生蚝一般生长在江河和大海的交汇处，附着在不超过10米水深的礁石上

3、大小区别。海蛎子一般个头较小，肉质较少，需要用尖刀得以破开外壳，而生蚝一般个头较大，肉质饱满较多，蒸熟可直接掰开外壳

4、外观区别。海蛎子一般表面褶皱明显，色泽偏黑，肉质大多为淡青色，而生蚝一般表面褶皱也较明显，但色泽黑白均匀，肉质大多为白色。