西南大学现任校长张卫国，任西南大学校长之前是重庆大学副校长，张卫国校长毕业于重庆大学。历任重庆大学计划财务处处长，副校长，2011年任西南大学校长，是西南大学第二任校长。首任校长是王小佳，是西南大学合并之前西南农业大学校长。