西南医院前身是1929年建立的“国民政府中央医院”，1950年11月西南军政委员会正式命名西南医院，为第三军医大学第一附属医院、第三军医大学西南临床医学院。西南医院拥有国家教育部重点(培育)学科12个、博士授权点31个，博硕士生导师218人，年培养从本科到博士后各层次学生3000余人，产生3位院士，3次获得国家科技进步一等奖。