空闲时间可以用紫外灯消毒，培养期间则不能，否则会杀伤木耳菌种。

对于各种病菌需要的杀毒时间不同，而且现在的紫外线消毒也有很多种，用紫外线灯消毒室内空气时。房间内应保持清洁于燥，减少尘埃和水雾，温度低于20℃或高于40℃，相对湿度大于60%时应适当延长照射时间。