砂仁易虫蛀，受潮生霉，久存泛油。多蛀蚀种子团的纵薄膜隔及果皮，使其散碎。

储藏期间，多用密封抽氧充氮养护。小件可在包装内置生石灰、无水氯化钙等吸潮。轻度吸潮或生霉、虫蛀品，可摊晾，忌曝晒。