这个原因很复杂，系统问题的可能性很大，也有可能是交易复杂出现的，苹果刷卡需要一整套复杂流程，导致使用不当重复扣费也是有可能的 。

因为iPhone的NFC芯片与公交系统存在兼容性问题，目前苹果没有给出解决方案。可以等待苹果的改进。

建议：可以向相关责任人进行申诉。