目前，山东农业工程学院还没有硕士点。

山东农业工程学院2017年才被批准为学士学位授予单位，设有16个二级学院（部），设有30个本科专业，没有硕士授权专业。主要本科专业如下：

设施农业科学与工程、园艺、动物医学，森林保护、中药资源与开发、风景园林，资源循环科学与工程、环境生态工程，机械工程、机械电子工程、电气工程及其自动化