印度的板块撞击亚欧板块形成青藏高原时形成的。 

祁连山原为古生代的大地槽,后经加里东运动和华力西运动,形成褶皱带。白垩纪以来祁连山主要处于断块升降运动中,最后形成一系列平行地垒(或山岭)和地堑(谷地、盆地)。自北而南包括 8个岭谷。