1、由于质量需扣款，若有确切退货数量：

借：应付账款

货：原材料（未税，数量同时减少）

货：应交税金－应交增值税（进项税转出）

此时对方可能会要求办理退货协议，办理后对方会开具红字发票。

若开具红字发票，则：

借：原材料　（红字）

借：应交税金—应交增值税（进项税额）　（红字）

货：应付账款　（红字）

2、若指定扣多少钱，与数量无关，则直接冲材料成本及可。