农业农村部公布的饲用微生物菌种目录有七大类，即乳酸菌类，双歧杆菌类，芽孢杆菌类，酵母类，霉菌类，光合细菌类和丙酸杆菌类。实际生产中使用的常见菌种有三大类，即乳酸菌类，芽孢杆菌类和酵母类，主要用于蓄禽等的饮水，拌料，全价料和饲料原料发酵，旨在改善动物肠道菌群，提高动物机体免疫力，提高饲料消化利用率，同时减少废物排泄量，臭气排泄量，实现源头减排，降低粪污处理压力。