荆芥刚发芽的种子形态：小坚果三棱状椭圆形，表面棕色或棕褐色，略有光泽，解剖镜下可见密布小麻点。背面及两侧面均较平，腹面下部有棱，直达白色小圆点状果脐，果皮浸水后粘液化，内含种子1枚。

种子椭圆形，表面污白色或淡棕黄色，顶端钝，腹面具一棕色线形种脊，合点位于种子中部稍上方，种脐位于种子近下端，种皮薄膜质。

胚直生，白色，含油分，胚根细小，子叶2枚，肥厚，卵状椭圆形，基部微心形。千粒重0.25克。