两者区别如下：

一、工艺不同

1、生料酒曲：

采用单纯糖化酶和活性干酵母配制的。

2、熟料酒曲：

熟料高产酿酒酒曲为特殊酒曲，属纯生物复合制剂。能将任何生物淀粉彻底糖化，将糖分彻底发酵转化为酒。

二、用途不同

1、生料酒曲：

适用于含用淀粉或糖分的粮谷、果蔬，利用生料发酵方法生产各种蒸馏白酒和发酵酒。

2、熟料酒曲：

麦曲主要用于黄酒的酿造红曲主要用于红曲酒的酿造大曲用于蒸馏酒的酿造。