《忍者神龟》2012第五季结局是神龟们各个骁勇善战，身怀绝技，为了维护正义，保卫城市家园，他们同狡猾的巴克斯特斯多克曼博士、紫龙帮的坏蛋以及一伙神秘且训练有素的忍者展开殊死搏斗。里奥失去了记忆，成为反派，最后被拉斐尔唤醒，兄弟四人团聚后，大家都上了天堂。