不同城市的医保卡余额进行合并，可以这样操作：

1、持职工本人身份证、社保卡、原单位离职证明先到原参保社保局要求出具《基本养老保险转移参保凭证》

2、再将上述凭证、身份证原件+复印件、社保卡到目前参保的社保局，同时填写一份《参保人员基本养老保险关系转入申请表》

3、资料提交后，通常45天左右完成转移。