副科长与主办有以下区别：

一是副科长属于领导职务，主办不是，二是提拨副科长一般要经过一定的组织程序，并经组织部门考察合格，才能提交领导班子讨论决定，主办不需要这些程序。

三是副科长的任命必须经单位领导班子集体决定，并有一定的公示期。主办一般单位主管领导提名，组织部门任命即可。