当然有毕业证，只要是称得上博士的，必须是有博士学位证和毕业证，这是博士身份的唯一证明，工程博士也是博士，只是所处的研究领域是工程类，工程类包括范围很广，有生物工程，材料工程，农业工程等，和其他类博士是一样的学历水平，没有高低贵贱之分。