专科医院和公立医院有区别，但也有相同点，如果专科医院也是公立的，那两者都是非营利性质，如前者是民营的那它的性质则相反，就是以营利为目的，公立医院一般是综合医院，科室设置较为齐全，综合实力也较专科强，专科医院在某一科目上是有优势，其他科室则比不上的。