天然水晶硬度比较硬的，不会那么容易摔坏。天然水晶硬度7，为摩氏硬度，相当于钢锉一般坚硬。相对密度在每立方厘米2.56至2.66克。

天然水晶清澈透明，常含有云雾状、星点状或絮状气液包体，并往往有微裂纹。此外，天然水晶有偏光性，可见双晶现象。天然水晶有冰凉之感，而玻璃有温感。