配制海藻酸钠溶液时，需要用酒精灯加热，边加热边搅拌，加热用小火，又或者间断加热，只能用高压蒸汽灭菌法。高压蒸汽灭菌法效果比较好，即可以杀死表面微生物，又可以杀死海藻酸钠内部的微生物的芽孢和孢子。

也可以用过滤除菌，需要使用高压罐，用2-3kg氮气压过去，压力不超过过滤器的起泡点即可。