冬瓜储存室的选择和消毒储存室要选择阴凉，通风，略微干燥的地方作为储存室。无论什么样的储存室，在冬瓜入储前，都要用20%二氯异氰尿酸钠800倍液喷施，或者用硫磺熏蒸法对储室，棚架，草衫等进行消毒，消毒后要进行通风降温。

药物杀菌保鲜冬瓜储存时，要用25%咪鲜胺800倍液喷瓜，或用70%甲基硫菌灵600倍液沾瓜，无论喷瓜、沾瓜都要做到药液均匀。