树化石又称木化石、硅化木。它是由树木演化而成。大约在1.5亿年前，树木因地质作用（或火山喷发或地壳运动）将其埋入地下，由于处于缺水的干旱环境下，或由于与空气断绝木质不易腐烂，而在漫长的地质作用过程中被二氧化硅交换了木质的纤维结构，并保存了枝干的外形。几经地质变迁，沧海桑田，陆地上升，使这些埋藏地下的树干重见天日。

它的木质细胞经矿物填充和代替后，给溶于水中的铁、锰氧化物染上黄、红、紫、黑和淡灰等颜色，就成了今天五彩斑斓、镶金叠玉的树化石。