鳄雀鳝的天敌和克星是美洲鳄、大型猛禽、水獭、渔貂等。其中水獭、渔貂是幼小鳄雀鳝的天敌。

鳄雀鳝很凶，会咬各种小鱼，因此若是混养的最好不好跟鳄雀鳝混养，且要养的话，也要跟体型比它大的鱼混养。

鳄雀鳝危害很大，它是肉食鱼类，具有极强的破坏性和攻击性，若是放到天然水域，会对当地的水体生态系统带来灭顶之灾，就是只要是水里的活物，它几乎通吃，且一旦在当地落脚，就会吃光鱼，长期以往，一条鱼可吃光湖中所有的鱼